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港基因組中心建本地首個大型數據庫

【本報訊】由政府成立的香港基因組中心正建立本港首個大型基因組數據庫,今年中新設立數據研究平台並制定流程,擬下半年開放予本地大學等合作伙伴使用數據庫作科研。香港基因組中心行政總裁羅思偉說正參考海外經驗制定收費政策,最快2026至2027年開放予更多私營企業可用數據庫,推動本港科研之餘,更可造福病人。

醫衛局轄下的香港基因組中心2021年起全面運作,透過香港兒童醫院等7間伙伴醫院招募合適病人及家人,目標最遲明年為來自2萬個家庭的4萬至5萬名參加者,免費做全基因組測序,以尋找病因和制定個人化治療方案,並建構基因組數據庫。

中心截至上月招募了3.1萬人,涵蓋未能確診病症、與遺傳有關癌症,以及與基因組學及精準醫學有關個案,數據庫數據量已近4000TB,相當於3萬部128GB的智能電話。

中心今年內將共享數據庫的去識別化數據,羅思偉稱中心近期成立數據研究平台,並制定數據使用流程,擬今年下半年優先開放予本港兩間大學醫學院等合作伙伴,透過登入平台使用數據庫特定資料,最快2026至27年開放讓其他私營企業申請,經審批後可使用。被問會否向私營企業收費,他說正着手釐定收費政策,將參考英國等地經驗,未有定案。

中心實驗室採用的單方向流程取得國際認可,所有樣本由接收、提取DNA至化驗和分析都「不走回頭路」,免樣本混雜污染。羅思偉透露,有大型跨國醫藥公司已主動接觸尋求合作,但非有意使用中心數據庫,而是看中其實驗室規格,冀外判基因組測序和分析工作予中心,以加快藥廠臨牀試驗。

香港基因組中心首席醫務及科學總監鍾侃言稱國際藥廠研發新藥後,會希望分析在亞洲是否有效,中心則可協助分析本地基因會否影響藥效或增加副作用,有助令新藥更快在港推出。

中心截至2024/25年度共獲政府撥款12億元運作,首個策略計劃明年屆滿。羅思偉稱已用7億元經費,有信心完成收集4萬至5萬個樣本,並正與醫衛局釐定下一個5年計劃,方向圍繞增加招募渠道、擴大數據庫及開放數據合作。他稱據海外經驗,基因組數據庫至少須有16萬至20萬個樣本才有競爭力,最好達50萬個,並冀在基因測序常規化後,中心長遠達至自負盈虧。

鍾侃言說,數據庫開放初期須安排研究團隊前來位於科學園的中心登入平台,日後將容許遙距登入,包括海外藥企。他說研究團隊將以數據存取方式使用數據庫,做法參考國際基因組數據庫,令資料毋須離開中心或香港,以免受地緣政治影響。

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